Если будет получать чешское гражданство, то поменяется на то, как в свидетельстве о браке. Потому что на эту фамилию выдают обчанку. Но вообще я не знала, что до получения чешского гражданства можно быть в реестре..

эта тема обсуждалась не так давно. Поищите
У меня после свадьбы написание изменилось + отчетство добавилось. Важно понимать, что у иностранцев может быть «два» регистра. Один находится в МВЧР, там всё согласно паспорту. Во второй, так называемый «матричный», попадают данные из матрики (при рождении ребенка, женитьбе и т.д.).

Я думаю, что Registr obyvatelu подтягивает данные из матрики в приоритетном порядке, и если их там нет, то из МВЧР. А уже со временем банки и другие организации подтягивают данные из регистра или из матрики. И будет у вас две возможности как себя называть и обе правильные))) Я пишу обе или согласно паспорту.